MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015574	CCT	2	6	31750	31755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986270
502	NC_015574	TGA	2	6	31762	31767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986270
503	NC_015574	CTTG	2	8	31769	31776	0 %	50 %	25 %	25 %	333986270
504	NC_015574	CCA	2	6	31796	31801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986270
505	NC_015574	T	6	6	31931	31936	0 %	100 %	0 %	0 %	333986270
506	NC_015574	T	7	7	31956	31962	0 %	100 %	0 %	0 %	333986270
507	NC_015574	TGG	2	6	32027	32032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986270
508	NC_015574	TTC	2	6	32216	32221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986271
509	NC_015574	CTTTT	2	10	32308	32317	0 %	80 %	0 %	20 %	333986271
510	NC_015574	TTA	2	6	32341	32346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986271
511	NC_015574	TC	3	6	32354	32359	0 %	50 %	0 %	50 %	333986271
512	NC_015574	T	6	6	32402	32407	0 %	100 %	0 %	0 %	333986271
513	NC_015574	TCA	2	6	32592	32597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986271
514	NC_015574	TCT	2	6	32601	32606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986271
515	NC_015574	AGG	2	6	32633	32638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986271
516	NC_015574	T	7	7	33330	33336	0 %	100 %	0 %	0 %	333986272
517	NC_015574	CAT	2	6	33337	33342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986272
518	NC_015574	CATC	2	8	33351	33358	25 %	25 %	0 %	50 %	333986272
519	NC_015574	CTT	2	6	33366	33371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986272
520	NC_015574	GT	3	6	33399	33404	0 %	50 %	50 %	0 %	333986272
521	NC_015574	TGC	2	6	33481	33486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986272
522	NC_015574	CCAT	2	8	33492	33499	25 %	25 %	0 %	50 %	333986272
523	NC_015574	AATG	2	8	33532	33539	50 %	25 %	25 %	0 %	333986272
524	NC_015574	ATT	2	6	33868	33873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986273
525	NC_015574	GCAC	2	8	34033	34040	25 %	0 %	25 %	50 %	333986273
526	NC_015574	GAA	2	6	34085	34090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986273
527	NC_015574	AAC	2	6	34150	34155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986273
528	NC_015574	GATT	2	8	34164	34171	25 %	50 %	25 %	0 %	333986273
529	NC_015574	A	6	6	34228	34233	100 %	0 %	0 %	0 %	333986273
530	NC_015574	AGA	2	6	34249	34254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986273
531	NC_015574	AAT	2	6	34261	34266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986273
532	NC_015574	AATA	2	8	34289	34296	75 %	25 %	0 %	0 %	333986273
533	NC_015574	GCA	2	6	34316	34321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986273
534	NC_015574	TGA	2	6	34339	34344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986273
535	NC_015574	AT	3	6	34424	34429	50 %	50 %	0 %	0 %	333986273
536	NC_015574	TAC	2	6	34430	34435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986273
537	NC_015574	ATA	2	6	34446	34451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986273
538	NC_015574	GATA	2	8	34516	34523	50 %	25 %	25 %	0 %	333986273
539	NC_015574	AAC	2	6	34541	34546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986273
540	NC_015574	TTC	2	6	34575	34580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986273
541	NC_015574	AAT	2	6	34688	34693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986274
542	NC_015574	TCAAG	2	10	34710	34719	40 %	20 %	20 %	20 %	333986274
543	NC_015574	AGT	2	6	34721	34726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986274
544	NC_015574	CTG	2	6	34806	34811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986274
545	NC_015574	AT	3	6	34846	34851	50 %	50 %	0 %	0 %	333986274
546	NC_015574	AGT	2	6	34873	34878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986274
547	NC_015574	A	6	6	34881	34886	100 %	0 %	0 %	0 %	333986274
548	NC_015574	AC	3	6	34926	34931	50 %	0 %	0 %	50 %	333986274
549	NC_015574	TAC	2	6	34934	34939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986274
550	NC_015574	TGT	2	6	35002	35007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986274
551	NC_015574	GAA	2	6	35182	35187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986274
552	NC_015574	CTT	2	6	35205	35210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986274
553	NC_015574	ATTA	2	8	35248	35255	50 %	50 %	0 %	0 %	333986274
554	NC_015574	CAA	2	6	35362	35367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986274
555	NC_015574	TG	3	6	35369	35374	0 %	50 %	50 %	0 %	333986274
556	NC_015574	AAGGT	2	10	35475	35484	40 %	20 %	40 %	0 %	333986274
557	NC_015574	TGACTG	2	12	35518	35529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333986274
558	NC_015574	CTT	2	6	35577	35582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986274
559	NC_015574	TGC	2	6	35602	35607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986274
560	NC_015574	CAC	2	6	35663	35668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986274
561	NC_015574	GTG	2	6	35703	35708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986274
562	NC_015574	GCA	2	6	36307	36312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986275
563	NC_015574	CTT	2	6	36371	36376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986275
564	NC_015574	CAT	2	6	36411	36416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986275
565	NC_015574	CTG	2	6	36470	36475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986275
566	NC_015574	T	7	7	36487	36493	0 %	100 %	0 %	0 %	333986275
567	NC_015574	CCTG	2	8	36533	36540	0 %	25 %	25 %	50 %	333986275
568	NC_015574	TAA	2	6	36587	36592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986275
569	NC_015574	CTT	2	6	36602	36607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986275
570	NC_015574	T	6	6	36702	36707	0 %	100 %	0 %	0 %	333986275
571	NC_015574	TTA	2	6	36743	36748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986275
572	NC_015574	ATC	2	6	36756	36761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986275
573	NC_015574	T	8	8	36832	36839	0 %	100 %	0 %	0 %	333986275
574	NC_015574	ATG	2	6	36846	36851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986275
575	NC_015574	TGGTC	3	15	36854	36868	0 %	40 %	40 %	20 %	333986275
576	NC_015574	GTCT	2	8	36894	36901	0 %	50 %	25 %	25 %	333986275
577	NC_015574	ACA	2	6	36907	36912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986275
578	NC_015574	TGT	2	6	36923	36928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986275
579	NC_015574	CAT	2	6	36956	36961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986275
580	NC_015574	A	7	7	37274	37280	100 %	0 %	0 %	0 %	333986276
581	NC_015574	CAC	2	6	37281	37286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986276
582	NC_015574	ATT	2	6	37298	37303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986276
583	NC_015574	TCA	2	6	37320	37325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986276
584	NC_015574	TTGT	2	8	37337	37344	0 %	75 %	25 %	0 %	333986276
585	NC_015574	GAA	2	6	37345	37350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986276
586	NC_015574	CCA	2	6	37468	37473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986276
587	NC_015574	GAA	2	6	37477	37482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986276
588	NC_015574	ATC	2	6	37546	37551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986276
589	NC_015574	TTC	2	6	37600	37605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986276
590	NC_015574	AAT	2	6	37711	37716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986276
591	NC_015574	T	6	6	37783	37788	0 %	100 %	0 %	0 %	333986276
592	NC_015574	TCAA	2	8	37883	37890	50 %	25 %	0 %	25 %	333986276
593	NC_015574	GAT	2	6	38215	38220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986277
594	NC_015574	TTA	2	6	38263	38268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986277
595	NC_015574	TCTGT	2	10	38313	38322	0 %	60 %	20 %	20 %	333986277
596	NC_015574	ATC	3	9	38511	38519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986278
597	NC_015574	TC	3	6	38615	38620	0 %	50 %	0 %	50 %	333986278
598	NC_015574	TGGC	2	8	38626	38633	0 %	25 %	50 %	25 %	333986278
599	NC_015574	ATG	2	6	38758	38763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986278
600	NC_015574	AAC	3	9	38787	38795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986278
601	NC_015574	CTG	2	6	39032	39037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986278
602	NC_015574	TGTT	2	8	39053	39060	0 %	75 %	25 %	0 %	333986278
603	NC_015574	TCCA	2	8	39069	39076	25 %	25 %	0 %	50 %	333986278
604	NC_015574	AAT	2	6	39117	39122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986278
605	NC_015574	TATT	2	8	39241	39248	25 %	75 %	0 %	0 %	333986278
606	NC_015574	T	6	6	39261	39266	0 %	100 %	0 %	0 %	333986278
607	NC_015574	CTT	2	6	39329	39334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986278
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609	NC_015574	ATG	2	6	39704	39709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986279
610	NC_015574	AT	3	6	39764	39769	50 %	50 %	0 %	0 %	333986279
611	NC_015574	AGA	2	6	39859	39864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986279
612	NC_015574	ATTT	2	8	39891	39898	25 %	75 %	0 %	0 %	333986279
613	NC_015574	TGG	2	6	40068	40073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986279
614	NC_015574	GTG	2	6	40076	40081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986279
615	NC_015574	TGG	2	6	40083	40088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986279
616	NC_015574	T	6	6	40221	40226	0 %	100 %	0 %	0 %	333986279
617	NC_015574	GGA	2	6	40229	40234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986279
618	NC_015574	AAG	2	6	40255	40260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986279
619	NC_015574	ATT	2	6	40364	40369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986279
620	NC_015574	T	6	6	40375	40380	0 %	100 %	0 %	0 %	333986279
621	NC_015574	GA	3	6	40652	40657	50 %	0 %	50 %	0 %	333986280
622	NC_015574	A	6	6	40670	40675	100 %	0 %	0 %	0 %	333986280
623	NC_015574	A	6	6	40764	40769	100 %	0 %	0 %	0 %	333986280
624	NC_015574	ATG	3	9	40818	40826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986280
625	NC_015574	CAT	3	9	40894	40902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986280
626	NC_015574	GGA	3	9	40906	40914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986280
627	NC_015574	CAT	2	6	40930	40935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986280
628	NC_015574	A	6	6	40967	40972	100 %	0 %	0 %	0 %	333986280
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630	NC_015574	G	6	6	41137	41142	0 %	0 %	100 %	0 %	333986280
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